DONATE

Biomimetic systems for cell engineering

The Biomimetic systems for cell engineering group is a junior group under IBEC’s Tenure Track scheme.

About

The “Biomimetic Systems for Cell Engineering” group is a multidisciplinary research group focussing its research activities on the development and application of new artificial systems that mimic tissue micro and nanofeatures for biomimetic in vitro assays.

The use of more biomimetic and complex 3D models in in vitro assays is now a hot and extremely relevant topic.

“Flat biology” results are questioned when being transferred to in vivo, while the pressure to decrease animal testing continues increasing. As a group of engineering providers working in the biotechnological field, we see these issues as both a challenge and a clear opportunity to impact the field with novel technological solutions. Our research ambition will be to develop better engineering tools to help in the development of organotypic cell culture models, easy to implement in daily cell culture routines, so they have a real and meaningful impact in the biotechnological arena and, therefore, will impact applications in basic cell research, disease modelling and regenerative medicine.

Along with this line, we are working towards the following objectives: (i) to engineer and validate a complex in vitro model of small intestinal epithelium, (ii) to validate a novel in vitro model of engineered cardiac tissue and (iii) to engineer a novel vessel-on-chip to reproduce the tumor metastatic environment. To carry out our research we employ cutting edge biofabrication technologies such as bioprinting and novel biological tools such as organoids.

 

Staff

Projects

INTERNATIONAL PROJECTSFINANCERPI
GUT3D-PLATE · Ready-to-use cell culture plates for gut 3D models (2020-2022)European Commission, ERC-PoCElena Martínez
COMIET · Engineering Complex Intestinal Epithelial Tissue Models (2015-2022)ERC Consolidator GrantElena Martínez
BRIGHTER · BIOPRINTING BY LIGHT-SHEET LITHOGRAPHY (2019-2023)European Commission FET OpenElena Martínez
PRIVATELY FUNDED PROJECTSFINANCERPI
PROMISE · BioPrinted hydROgel MicrofluIdicS to mimic patient-specific tumor mEtastatic microenvironment (2020-2023)Obra Social La Caixa, Health Research Call for ProposalsElena Martínez
FINISHED PROJECTSFINANCERPI
ENGUT · Engineered models of intestinal epithelial tissue: assessing in vivo-like functional properties (2019-2020)Bist Ignite ProgramElena Martínez
INDUCT Dispositivo de multitejido intestinal para la monitorización de la comunicación entre epitelio y músculo en condiciones patológicas (2018-2020)MINECOElena Martínez
COMIET Engineering Complex Intestinal Epithelial Tissue Models (2015-2020)ERC Consolidator GrantElena Martínez
GLAM Glass-Laser Multiplexed Biosensor (2015-2019)European Commission (H2020) – PHC-10-2015Elena Martínez
MINAHE5 (Bio)funcionalización de Micro- y NanoHerramientas en Suspensión para Aplicaciones en Células Vivas (2015-2017)MINECOMaria Lluïsa Pérez

Publications

Equipment

Micro and nanofabrication techniques:

  • Biomolecule gradients produced by microfluidics
  • Large-area nanostructured polymer surfaces produced by diblock copolymers
  • 3D microstructures on hydrogel materials
  • Mini-bioreactor for 3D cell culture

Characterization techniques:

  • Surface Plasmon Resonance (SPR) measurements on polymer materials
  • Atomic Force Microscope (AFM) expertise
  • Optical Microscopes (white light/epifluorescence)
  • Focused Ion Beam (FIB) / Scanning Electron Microscopy (SEM) of biological specimens

Equipment:

  • Biological safety cabinet (class II)
  • High precision syringe pumps
  • Peristaltic pumps
  • Access to the Nanotechnology Platform (IBEC Core Facilities): equipment for hot embossing lithography, polymer processing and photolithography, chemical wet etching, e-beam evaporation and surface characterization (TOF-SIMS)
  • Access to the Scientific and Technological Centers (University of Barcelona): equipment for surface analysis (XPS, AFM, XRD) and microscopy techniques (SEM, TEM, confocal)
  • PRUSA i3MK3S (FDM printer) 
  • Phrozen Shuffle XL (DLP-SLA printer)
  • SOLUS (DLP-SLA printer)

Collaborations

  • Prof. Ángel Raya / Dr. Samuel Ojosnegros
    Center of Regenerative Medicine in Barcelona (CMRB), Barcelona
  • Prof. Eduard Batlle
    Institut de Recerca Biomédica (IRB), Barcelona
  • Prof. Pablo Loza
    Institut de Ciències Fotòniques (ICFO), Castelldefels (Spain)
  • Dr. Javier Ramón, IBEC
  • Dr. Elisabeth Engel, IBEC
  • Prof. Raimon Jané, IBEC
  • Prof. Josep Samitier, IBEC
  • Prof. Javier Santos, Dra. Maria Vicario
    VHIR, Barcelona (Spain)
  • Dr. Bruno Sarmento
    i3S – Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Porto, Portugal
  • Dr. Sonia García-Blanco
    University of Twente, Enschede (The Netherlands)
  • Dr. Fabio Variola
    University of Ottawa (Canada)
  • Dr. Daniel Riveline
    ISIS/IGBMC, Strasbourg (France)
  • Dr. Matthew Dalby
    University of Glasgow (UK)
  • Prof. Jordi Martorell
    Institut de Ciències Fotòniques (ICFO), Castelldefels (Spain)
  • Prof. José Antonio Plaza
    CNM-CSIC, Barcelona
  • Dr. Francesc Mitjans
    LEITAT, Barcelona
  • Francesco Pampaloni
    Buchmann Institute for Molecular Life Sciences (Frankfurt)
  • Dra. Elena Élez
    VHIO

News

La bioenginyeria és una disciplina clau per a la medicina del futur i Europa n’és conscient. Prova d’això és que la Unió Europea (UE) ha concedit en els últims mesos la coordinació de tres nous projectes europeus a l’Institut de Bioenginyeria de Catalunya (IBEC) perquè segueixi combinant la medicina, la ciència i la tecnologia i contribueixi així a millorar la salut de les persones. El primer és el projecte BRIGHTER, que està liderat per la Professora i investigadora principal del grup ‘Sistemes biomimètics per a l’enginyeria cel·lular’ de l’IBEC Elena Martínez. La UE recolza aquesta iniciativa en la que l´IBEC i els seus socis del consorci desenvoluparan una nova tècnica de bioimpressió 3D d’alta resolució capaç de fabricar cultius cel·lulars tridimensionals que en un futur podrien ser útils per produir òrgans artificials.

L’IBEC lidera tres nous projectes europeus

La bioenginyeria és una disciplina clau per a la medicina del futur i Europa n’és conscient. Prova d’això és que la Unió Europea (UE) ha concedit en els últims mesos la coordinació de tres nous projectes europeus a l’Institut de Bioenginyeria de Catalunya (IBEC) perquè segueixi combinant la medicina, la ciència i la tecnologia i contribueixi així a millorar la salut de les persones. El primer és el projecte BRIGHTER, que està liderat per la Professora i investigadora principal del grup ‘Sistemes biomimètics per a l’enginyeria cel·lular’ de l’IBEC Elena Martínez. La UE recolza aquesta iniciativa en la que l´IBEC i els seus socis del consorci desenvoluparan una nova tècnica de bioimpressió 3D d’alta resolució capaç de fabricar cultius cel·lulars tridimensionals que en un futur podrien ser útils per produir òrgans artificials.

Elena Martínez, líder de grup a l’IBEC i professora de la UB, ha estat guardonada amb la prestigiosa beca «Proof of Concept» del Consell Europeu de Recerca (European Research Council, ERC per les seves sigles en anglès). Amb el seu projecte «GUT3D-PLATE», Martínez i el seu equip en el grup «Sistemes biomimètics per a l’enginyeria cel·lular» podran desenvolupar en profunditat la tecnologia per fabricar substrats de cultiu cel·lular en 3D que imitin la fisiologia intestinal a punt per comercialitzar.

Elena Martínez rep una beca de la «European Research Council» per portar la recerca al mercat

Elena Martínez, líder de grup a l’IBEC i professora de la UB, ha estat guardonada amb la prestigiosa beca «Proof of Concept» del Consell Europeu de Recerca (European Research Council, ERC per les seves sigles en anglès). Amb el seu projecte «GUT3D-PLATE», Martínez i el seu equip en el grup «Sistemes biomimètics per a l’enginyeria cel·lular» podran desenvolupar en profunditat la tecnologia per fabricar substrats de cultiu cel·lular en 3D que imitin la fisiologia intestinal a punt per comercialitzar.

Un sistema desenvolupat per investigadors de l’Institut de Bioenginyeria de Catalunya (IBEC) i del Centre de Medicina Regenerativa de Barcelona (CMR[B]) és capaç de produir al laboratori teixits que simulen el comportament del cor humà. Els teixits produïts per aquest sistema de bioenginyeria podrien servir per a preavaluar la toxicitat de medicaments en el cor sense necessitat d’utilitzar models animals. Les malalties cardiovasculars suposen actualment una de les primeres causes de mort a escala mundial. No obstant això, els factors que motiven o accentuen aquestes malalties del cor s’amaguen, a vegades, darrere d’elements no coneguts. Entre altres causes, els medicaments que són útils per a curar o pal·liar determinades malalties poden, al mateix temps, presentar efectes secundaris sobre altres òrgans com el cor, el que els experts coneixen com a cardiotoxicitat.

Un equip de recerca desenvolupa una minifàbrica de teixit cardíac humà

Un sistema desenvolupat per investigadors de l’Institut de Bioenginyeria de Catalunya (IBEC) i del Centre de Medicina Regenerativa de Barcelona (CMR[B]) és capaç de produir al laboratori teixits que simulen el comportament del cor humà. Els teixits produïts per aquest sistema de bioenginyeria podrien servir per a preavaluar la toxicitat de medicaments en el cor sense necessitat d’utilitzar models animals. Les malalties cardiovasculars suposen actualment una de les primeres causes de mort a escala mundial. No obstant això, els factors que motiven o accentuen aquestes malalties del cor s’amaguen, a vegades, darrere d’elements no coneguts. Entre altres causes, els medicaments que són útils per a curar o pal·liar determinades malalties poden, al mateix temps, presentar efectes secundaris sobre altres òrgans com el cor, el que els experts coneixen com a cardiotoxicitat.

Durant l’última dècada, els organoides intestinals s’han convertit en una eina crucial per estudiar la biologia intestinal in vitro. No obstant això, la seva geometria en forma d’esfera limita l’accés de llum de l’organoide, el que dificulta el seu ús en molts experiments funcionals en els quals es requereix accés independent als diferents costats de l’epiteli.

Una nova tecnologia de cultiu per a assajos funcionals intestinals

Durant l’última dècada, els organoides intestinals s’han convertit en una eina crucial per estudiar la biologia intestinal in vitro. No obstant això, la seva geometria en forma d’esfera limita l’accés de llum de l’organoide, el que dificulta el seu ús en molts experiments funcionals en els quals es requereix accés independent als diferents costats de l’epiteli.

Un grup d’experts de l’Institut de Bioenginyeria de Catalunya (IBEC) lidera el projecte europeu BRIGHTER (Bioprinting by light-sheet lithography: engineering complex tissues with high resolution at high speed), una iniciativa que busca desenvolupar un innovador sistema de bioimpressió 3D d’alta resolució que podria ajudar a produir teixits funcionals.

L’IBEC lidera un projecte europeu per al desenvolupament d’una nova tècnica de bioimressió 3D d’alta resolució

Un grup d’experts de l’Institut de Bioenginyeria de Catalunya (IBEC) lidera el projecte europeu BRIGHTER (Bioprinting by light-sheet lithography: engineering complex tissues with high resolution at high speed), una iniciativa que busca desenvolupar un innovador sistema de bioimpressió 3D d’alta resolució que podria ajudar a produir teixits funcionals.

El president del Consell Europeu d’Investigació (ERC), Jean-Pierre Bourguignon, va visitar el passat 15 de maig l’Institut de Bioenginyeria de Catalunya (IBEC). L’esdeveniment va ser inaugurat pel director de l’IBEC, Josep Samitier, qui va presentar una visió general de la investigació d’avantguarda portada que s realitza a l’Institut als camps de la bioenginyeria i la nanomedicina. Posteriorment, els investigadors amb concessió de fons ERC que treballem a l’IBEC van explicar com aquestes subvencions han les seves carreres professionals, i establir un diàleg amb el president de l’ERC sobre el passat, el present i el futur del Consell Europeu d’investigació.

El president del Consell Europeu d’Investigació visita l’IBEC

El president del Consell Europeu d’Investigació (ERC), Jean-Pierre Bourguignon, va visitar el passat 15 de maig l’Institut de Bioenginyeria de Catalunya (IBEC). L’esdeveniment va ser inaugurat pel director de l’IBEC, Josep Samitier, qui va presentar una visió general de la investigació d’avantguarda portada que s realitza a l’Institut als camps de la bioenginyeria i la nanomedicina. Posteriorment, els investigadors amb concessió de fons ERC que treballem a l’IBEC van explicar com aquestes subvencions han les seves carreres professionals, i establir un diàleg amb el president de l’ERC sobre el passat, el present i el futur del Consell Europeu d’investigació.

El grup Sistemes Biomimètics per enginyeria cel·lular, dirigit per Elena Martínez, ha desenvolupat un nou mètode per a generar teixit intestinal en 3D mitjançant l’ús d’hidrogels. Aquest nou model in vitro s’ha pogut millorar proporcionant a les cèl·lules un entorn fisiològicament realista, que inclou arquitectura tissular, interaccions cèl·lula-matriu i senyalització química, sense deixar de ser compatibles amb les tècniques estàndard de caracterització cel·lular. Els teixits epitelials contenen microtopografies tridimensionals complexes que són essencials per a desenvolupar correctament la seva funció.

Mètode sense motlles per a generar un model 3D de teixit intestinal mitjançant hidrogels

El grup Sistemes Biomimètics per enginyeria cel·lular, dirigit per Elena Martínez, ha desenvolupat un nou mètode per a generar teixit intestinal en 3D mitjançant l’ús d’hidrogels. Aquest nou model in vitro s’ha pogut millorar proporcionant a les cèl·lules un entorn fisiològicament realista, que inclou arquitectura tissular, interaccions cèl·lula-matriu i senyalització química, sense deixar de ser compatibles amb les tècniques estàndard de caracterització cel·lular. Els teixits epitelials contenen microtopografies tridimensionals complexes que són essencials per a desenvolupar correctament la seva funció.

Jemish Parmar, del grup de Nanodispositius intel·ligents, ha estat guardonat amb el Premi Pioner en l’edició de 2018 per la seva tesi doctoral anomenada “Micromotors per aplicacions mediambientals”. Des del seu llançament en 2014, els Premis Pioner reconeixen a investigadors que presenten una tesi doctoral amb resultats clarament orientats a l’explotació industrial o comercial. Jemish, el tercer estudiant de l’IBEC a guanyar un d’aquests prestigiosos guardons, va recollir ahir el seu premi en la cerimònia que es va celebrar en sala d’actes de la Secretària d’Universitats i Recerca de la Generalitat de Catalunya, juntament amb els altres tres seleccionats d’aquest any –del ICFO, CTFC i IGTP–.

Un investigador de l’IBEC guanya el Premi Pioner per la seva tesi doctoral

Jemish Parmar, del grup de Nanodispositius intel·ligents, ha estat guardonat amb el Premi Pioner en l’edició de 2018 per la seva tesi doctoral anomenada “Micromotors per aplicacions mediambientals”. Des del seu llançament en 2014, els Premis Pioner reconeixen a investigadors que presenten una tesi doctoral amb resultats clarament orientats a l’explotació industrial o comercial. Jemish, el tercer estudiant de l’IBEC a guanyar un d’aquests prestigiosos guardons, va recollir ahir el seu premi en la cerimònia que es va celebrar en sala d’actes de la Secretària d’Universitats i Recerca de la Generalitat de Catalunya, juntament amb els altres tres seleccionats d’aquest any –del ICFO, CTFC i IGTP–.

El grup de l’IBEC Biomimetic Systems for Cell Engineering ha publicat un article de revisió sobre noves estratègies per estudiar l’absorció de fàrmacs en l’intestí a la revista d’alt impacte Trends in Molecular Medicine. Juntament amb els seus col·laboradors a la Universidade do Porto, el grup d’Elena Martínez examina l’estat de l’art dels models intestinals basats en cèl·lules, que s’han utilitzat per a estudis d’absorció i metabolisme de fàrmacs des de la dècada de 1980.

Millors models in vitro per estudiar l’intestí humà

El grup de l’IBEC Biomimetic Systems for Cell Engineering ha publicat un article de revisió sobre noves estratègies per estudiar l’absorció de fàrmacs en l’intestí a la revista d’alt impacte Trends in Molecular Medicine. Juntament amb els seus col·laboradors a la Universidade do Porto, el grup d’Elena Martínez examina l’estat de l’art dels models intestinals basats en cèl·lules, que s’han utilitzat per a estudis d’absorció i metabolisme de fàrmacs des de la dècada de 1980.

Jobs